DigiCleaR USER'S MANUAL

Abstract (French)

Créer une machine

- Dans DigiCleaR il est possible de créer ses propres machines à usage privé. Il y a exactement les mêmes possibilités que sur les machines existantes et elles peuvent être partagées à volonté. vous en êtes le manager

Téléverser des fichiers en lien avec votre échantillon

- Sur toutes les machines il est possible d'uploader des fichiers associés à l'échantillon en cours. Les fichiers sont stockés sur ClearCloud (clearcloud.c2n.u-psud.fr) et partagés avec votre compte par DigiCleaR.

héritage entre échantillon et partage

- Il est possible de créer autant d'échantillon que l'on souhaite et de déclarer les liens de parenté entre échantillons. Il est possible de partager vos échantillons avec d'autres utilisateurs. On peut copier/coller la liste des utilisateurs entre échantillons (également entre projet, machines, etc)

les Requêtes (opération par un tiers)

- Si vous confiez votre échantillon à une tierce personne pour faire une étape, utilisez le système de requête. La personne en charge de votre échantillon aura ainsi accès à votre échantillon et votre projet sans rien faire. Pour faire une requête c'est le même système que pour une opération sur une machine, sauf que vous sélectionner “request” au lieu de “operation”. Ensuite votre requête sera dans la liste des requêtes à satisfaire et un autre utilisateur ou le manager pourra réaliser cette requête (après accord entre vous)

Les dates et la chronologie de votre échantillon

- Il y a désormais deux dates, recordDate et processDate. La recordDate est la date de saisie de la fiche process. La processDate est une date saisie par l'utilisateur pour pouvoir ordonner les étapes de son échantillon de manière chronologique.

Résumé

- création de machine : https://clearwiki.c2n.u-psud.fr/doku.php?id=digiclear:managingmachines#create_a_new_machine

- upload de fichier : https://clearcloud.c2n.u-psud.fr

- lien de parenté entre échantillon: https://clearwiki.c2n.u-psud.fr/doku.php?id=digiclear:managingsamples#select_parents_for_the_sample

- les requêtes :

faire une requête : https://clearwiki.c2n.u-psud.fr/doku.php?id=digiclear:usingmachines#new_operation
remplir une requête : https://clearwikic2n.u-psud.fr/doku.php?id=digiclear:usingmachines#requestfulfill_it

History

DigiCleaR is a software, web access, using PhP, Javascript and HTML5. It provides a database management system (PostGreSQL) to gather informations about samples, machines, projects and users of a cleanroom, or any kind of laboratories, that accepts many users level to use machines in open access mode.

This project was started by Stephane Guilet in 2013 with a first version using dokuwiki as a form provider and a SQLite database through plugin that manage all. This version was upgraded until 3.0, with the help of Laurent Couraud and Léandre Elmestour, by programming in php new plugins and changing the code of dokuwiki or using code injection. This was not safe at all and in 2018 we decided to recode everything from scratch. Léandre Elmestour was the main programmer, Laurent Couraud was the chief operator for the code management and Stéphane Guilet was the Project Leader. In September 2019, we achieved the first version of DigiCleaR 4.0

To Do List

Welcome and first login

When you go the the website: DigiCleaR main website, you will see the image as

First you must sign in DigiCleaR: click on
Enter your login and password (For C2N users it's the same as your Zimbra/Mail web app or Adonis account)

First you choose the machine you want to use if the machine is not connected to DigiClear.

if the machine is connected to DigiCleaR then the right machine should be already selected
if not you can click on to select automatically the machine you are working on.